MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium clariflavum DSM 19732 chromosome

Total Repeats: 83295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016627	ATA	2	6	682	687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294494
2	NC_016627	TACA	2	8	776	783	50 %	25 %	0 %	25 %	374294494
3	NC_016627	TGT	2	6	803	808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294494
4	NC_016627	TGG	2	6	1004	1009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294494
5	NC_016627	ATGC	2	8	1035	1042	25 %	25 %	25 %	25 %	374294494
6	NC_016627	TGC	2	6	1057	1062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294494
7	NC_016627	TCA	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294494
8	NC_016627	TCT	2	6	1095	1100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294494
9	NC_016627	TTA	2	6	1120	1125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294494
10	NC_016627	GAA	2	6	1149	1154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294494
11	NC_016627	GAT	2	6	1194	1199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294494
12	NC_016627	AGAA	2	8	1220	1227	75 %	0 %	25 %	0 %	374294494
13	NC_016627	GAA	2	6	1233	1238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294494
14	NC_016627	TTC	2	6	1239	1244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294494
15	NC_016627	CAAA	3	12	1270	1281	75 %	0 %	0 %	25 %	374294494
16	NC_016627	GAA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294494
17	NC_016627	A	7	7	1412	1418	100 %	0 %	0 %	0 %	374294494
18	NC_016627	ATT	2	6	1452	1457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294494
19	NC_016627	CAA	2	6	1594	1599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294494
20	NC_016627	AGA	2	6	1667	1672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294494
21	NC_016627	A	7	7	1683	1689	100 %	0 %	0 %	0 %	374294494
22	NC_016627	TAC	2	6	1796	1801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294494
23	NC_016627	A	6	6	1819	1824	100 %	0 %	0 %	0 %	374294494
24	NC_016627	GAA	2	6	1830	1835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294494
25	NC_016627	A	6	6	1877	1882	100 %	0 %	0 %	0 %	374294494
26	NC_016627	AAGA	2	8	2297	2304	75 %	0 %	25 %	0 %	374294495
27	NC_016627	TAC	2	6	2401	2406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294495
28	NC_016627	ATGTT	2	10	2462	2471	20 %	60 %	20 %	0 %	374294495
29	NC_016627	AAG	2	6	2534	2539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294495
30	NC_016627	TTC	2	6	2569	2574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294495
31	NC_016627	CTTC	2	8	2652	2659	0 %	50 %	0 %	50 %	374294495
32	NC_016627	A	6	6	2663	2668	100 %	0 %	0 %	0 %	374294495
33	NC_016627	A	6	6	2692	2697	100 %	0 %	0 %	0 %	374294495
34	NC_016627	GAAAAT	2	12	2850	2861	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374294495
35	NC_016627	GTA	2	6	2874	2879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294495
36	NC_016627	TAC	2	6	2914	2919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294495
37	NC_016627	GAA	2	6	2928	2933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294495
38	NC_016627	AAATC	2	10	2957	2966	60 %	20 %	0 %	20 %	374294495
39	NC_016627	ATT	2	6	3002	3007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294495
40	NC_016627	AT	3	6	3082	3087	50 %	50 %	0 %	0 %	374294495
41	NC_016627	GAA	2	6	3123	3128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294495
42	NC_016627	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	374294495
43	NC_016627	ATT	2	6	3171	3176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294495
44	NC_016627	GGA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294495
45	NC_016627	TAC	2	6	3224	3229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294495
46	NC_016627	GAT	2	6	3291	3296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294495
47	NC_016627	GAA	2	6	3297	3302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294495
48	NC_016627	AT	4	8	3307	3314	50 %	50 %	0 %	0 %	374294495
49	NC_016627	AAC	2	6	3357	3362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294495
50	NC_016627	A	6	6	3395	3400	100 %	0 %	0 %	0 %	374294495
51	NC_016627	AT	3	6	3456	3461	50 %	50 %	0 %	0 %	374294496
52	NC_016627	TAA	2	6	3524	3529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294496
53	NC_016627	GAAA	2	8	3575	3582	75 %	0 %	25 %	0 %	374294496
54	NC_016627	ACA	2	6	3614	3619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294496
55	NC_016627	A	6	6	3719	3724	100 %	0 %	0 %	0 %	374294497
56	NC_016627	ATT	2	6	3768	3773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294497
57	NC_016627	T	7	7	3781	3787	0 %	100 %	0 %	0 %	374294497
58	NC_016627	CAGG	2	8	3796	3803	25 %	0 %	50 %	25 %	374294497
59	NC_016627	AAC	2	6	3849	3854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294497
60	NC_016627	TA	3	6	3858	3863	50 %	50 %	0 %	0 %	374294497
61	NC_016627	AAG	2	6	3886	3891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294497
62	NC_016627	AAT	2	6	3905	3910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
63	NC_016627	AAAT	2	8	3940	3947	75 %	25 %	0 %	0 %	374294497
64	NC_016627	A	9	9	3958	3966	100 %	0 %	0 %	0 %	374294497
65	NC_016627	AGA	3	9	4047	4055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294497
66	NC_016627	GCA	2	6	4106	4111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294497
67	NC_016627	CT	4	8	4139	4146	0 %	50 %	0 %	50 %	374294497
68	NC_016627	A	7	7	4164	4170	100 %	0 %	0 %	0 %	374294497
69	NC_016627	AT	3	6	4189	4194	50 %	50 %	0 %	0 %	374294497
70	NC_016627	ATA	2	6	4227	4232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
71	NC_016627	TA	3	6	4279	4284	50 %	50 %	0 %	0 %	374294497
72	NC_016627	TAA	2	6	4301	4306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
73	NC_016627	ATT	2	6	4324	4329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294497
74	NC_016627	A	6	6	4366	4371	100 %	0 %	0 %	0 %	374294497
75	NC_016627	AGA	2	6	4376	4381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294497
76	NC_016627	AAT	2	6	4418	4423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
77	NC_016627	AT	4	8	4467	4474	50 %	50 %	0 %	0 %	374294497
78	NC_016627	ATA	2	6	4557	4562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
79	NC_016627	AGA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294497
80	NC_016627	TGA	2	6	4598	4603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294497
81	NC_016627	AAT	2	6	4656	4661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
82	NC_016627	TTA	2	6	4672	4677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294497
83	NC_016627	T	6	6	4696	4701	0 %	100 %	0 %	0 %	374294497
84	NC_016627	T	7	7	4726	4732	0 %	100 %	0 %	0 %	374294497
85	NC_016627	A	6	6	4739	4744	100 %	0 %	0 %	0 %	374294497
86	NC_016627	TGG	2	6	5018	5023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294498
87	NC_016627	TGT	2	6	5027	5032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294498
88	NC_016627	CTA	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294498
89	NC_016627	GAT	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294498
90	NC_016627	TAT	2	6	5168	5173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294498
91	NC_016627	AT	3	6	5199	5204	50 %	50 %	0 %	0 %	374294498
92	NC_016627	TAAA	2	8	5270	5277	75 %	25 %	0 %	0 %	374294498
93	NC_016627	ATG	2	6	5464	5469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294499
94	NC_016627	TCA	2	6	5541	5546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294499
95	NC_016627	AAT	2	6	5573	5578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294499
96	NC_016627	GAAATA	2	12	5619	5630	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374294499
97	NC_016627	GGA	2	6	5760	5765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294499
98	NC_016627	AT	4	8	5863	5870	50 %	50 %	0 %	0 %	374294499
99	NC_016627	GTAA	2	8	5898	5905	50 %	25 %	25 %	0 %	374294499
100	NC_016627	ACT	2	6	5946	5951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294499
101	NC_016627	AG	3	6	6018	6023	50 %	0 %	50 %	0 %	374294499
102	NC_016627	GAA	2	6	6075	6080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294499
103	NC_016627	ATT	2	6	6114	6119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294499
104	NC_016627	AAG	2	6	6148	6153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294499
105	NC_016627	ATTT	2	8	6171	6178	25 %	75 %	0 %	0 %	374294499
106	NC_016627	TGCAA	2	10	6212	6221	40 %	20 %	20 %	20 %	374294499
107	NC_016627	ACA	2	6	6262	6267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294499
108	NC_016627	ATT	2	6	6352	6357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294499
109	NC_016627	CTG	2	6	6409	6414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294499
110	NC_016627	TAA	2	6	6415	6420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294499
111	NC_016627	ACAA	2	8	6452	6459	75 %	0 %	0 %	25 %	374294499
112	NC_016627	AAACT	2	10	6460	6469	60 %	20 %	0 %	20 %	374294499
113	NC_016627	AAG	2	6	6485	6490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294499
114	NC_016627	T	6	6	6527	6532	0 %	100 %	0 %	0 %	374294499
115	NC_016627	AGA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294499
116	NC_016627	A	6	6	6568	6573	100 %	0 %	0 %	0 %	374294499
117	NC_016627	CAG	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294499
118	NC_016627	AGC	2	6	6599	6604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294499
119	NC_016627	AAG	2	6	6626	6631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294499
120	NC_016627	ACA	2	6	6651	6656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294499
121	NC_016627	TG	3	6	6700	6705	0 %	50 %	50 %	0 %	374294499
122	NC_016627	AT	4	8	6708	6715	50 %	50 %	0 %	0 %	374294499
123	NC_016627	GGA	2	6	6735	6740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294499
124	NC_016627	AGA	2	6	6762	6767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294499
125	NC_016627	ATT	2	6	6927	6932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294499
126	NC_016627	AT	3	6	6995	7000	50 %	50 %	0 %	0 %	374294499
127	NC_016627	AGA	2	6	7070	7075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294499
128	NC_016627	A	6	6	7105	7110	100 %	0 %	0 %	0 %	374294499
129	NC_016627	A	6	6	7131	7136	100 %	0 %	0 %	0 %	374294499
130	NC_016627	AGC	2	6	7256	7261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294499
131	NC_016627	AT	3	6	7351	7356	50 %	50 %	0 %	0 %	374294499
132	NC_016627	AAT	2	6	7827	7832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294500
133	NC_016627	ACT	2	6	7870	7875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294500
134	NC_016627	CCTG	2	8	7892	7899	0 %	25 %	25 %	50 %	374294500
135	NC_016627	A	6	6	7912	7917	100 %	0 %	0 %	0 %	374294500
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137	NC_016627	ATTGAT	2	12	7927	7938	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374294500
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269	NC_016627	CTT	2	6	14337	14342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294505
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273	NC_016627	ATA	2	6	14634	14639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294505
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